Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms