Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms