Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EGR1P18146 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EGR1P18146 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EGR1P18146 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms