Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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