Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCAO15360 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCAO15360 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCAO15360 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCAO15360 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms