Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCF2LO15068 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms