Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms