Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DKK3Q9UBP4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms