Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms