Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms