Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COPS8Q99627 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms