Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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