Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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TCF23Q7RTU1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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