Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms