Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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