Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms