Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms