Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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