Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms