Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ACTBP60709 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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