Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APODP05090 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APODP05090 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APODP05090 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
APODP05090 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APODP05090 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APODP05090 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
APODP05090 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APODP05090 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APODP05090 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms