Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSF2P04141 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF2P04141 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF2P04141 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF2P04141 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF2P04141 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSF2P04141 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSF2P04141 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSF2P04141 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF2P04141 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF2P04141 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSF2P04141 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSF2P04141 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms