Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSI1O43347 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSI1O43347 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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MSI1O43347 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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MSI1O43347 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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MSI1O43347 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSI1O43347 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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