Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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LRRTM2O43300 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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