Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms