Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNK4Q9NYG8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms