Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 405.8 ms