Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms