Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF17Q9BXT8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms