Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CARD11Q9BXL7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CARD11Q9BXL7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms