Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC2P3Q9BVR0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms