Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMIEQ8NEW7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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