Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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