Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFCP2Q12800 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms