Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms