Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms