Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS1P17812 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms