Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APODP05090 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APODP05090 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APODP05090 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APODP05090 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms