Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRTO14522 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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