Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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