Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BHLHE41Q9C0J9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms