Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL3Q9BXA9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms