Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF7Q9BWX1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms