Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms