Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms