Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP34Q70CQ2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms