Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms