Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms