Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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