Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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RYR3Q15413 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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RYR3Q15413 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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RYR3Q15413 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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RYR3Q15413 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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RYR3Q15413 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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RYR3Q15413 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
RYR3Q15413 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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